ФОРУМ ВИНОГРАД

Виноград, ягодники, посадка, новые сорта, удобрения. Болезни и вредители винограда.
Сайт    •Сорта    •Статьи    •Саженцы    •Новости    •Анализ плодоношения сортов

Текущее время: 21 янв 2018, 17:33

Часовой пояс: UTC + 3 часа



Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 2821 ]  На страницу Пред.  1 ... 279, 280, 281, 282, 283  След.
Автор Сообщение
 Заголовок сообщения: Re: Опыт по опровержению теории питания растений
Непрочитанное сообщениеДобавлено: 19 дек 2017, 15:47 
Не в сети
Завсегдатай
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 09 фев 2010, 19:11
Сообщения: 959
Благодарил (а): 1679 раз.
Поблагодарили: 3441 раз.
Город: Волгоград
Подпись: Владимир
skype: ankudinov-vladimir
"Влияние солевого стресса на ассимиляцию и трансляцию углерода и азота в саженцах риса.
Взрослые саженцы риса, выращенные на гидропонике, подвергали воздействию 100 микроМоль хлорида натрия в течение 6 дней перед экспериментом по маркировке. Необработанные растения служили контролем. Сразу же после импульсов маркировки корневое 15N-обогащение составляло 4 190 ‰ +_ 25 ‰ в контрольных растениях и только 2 490 ‰ +_ 160 ‰ в стрессовых растениях, что соответствовало снижению поглощения аммония в 40% (рис.2). Кроме того, значительно снижалась транслокация азота из корня в побег, что приводило к значительно меньшему обогащению (43-62%) в побеге стрессовых растений по сравнению с контрольными растениями во все моменты времени отбора проб. Напротив, ассимиляция углерода в побеге была достаточно неизменной (рис. 2А). Как описано выше для необработанных контрольных растений, распределение углерода и азота было выведено для стрессовых растений путем интеграции данных маркировки 13С и 15N. Отношение корень/побег, оцениваемое по уравнению 4, было незначительно увеличено в условиях стресса (0,165 +_ 0,01 для контрольных растений по сравнению с 0,173 +_0,03 для стрессовых растений). Относительное распределение углерода не изменилось у растений, подверженных стрессам (рис.3). Однако значительно изменилось распределение азота , что привело к извлечению 30% ассимилированного азота из корней по сравнению с 15% в контрольных растениях. Количество меченого азота, переносимого в побег, соответственно уменьшалось, результат был 69% против 86% у контрольных растений (фиг.3В).
Количественная оценка ассимиляции углерода во взрослых растениях риса.
На этапах цветения и налива зерна рисовые растения имеют разные типы листьев (то есть нормальные листья и флаговые листья ). Лист флаговый - это самый верхний лист на вершине и основной углерод-носитель для метелки, когда он полностью развит (Rawson and Hofstra, 1969). Сравнивались модели ассимиляции растений на разных стадиях развития, отобранные сразу после 10-минутного облучения мечеными атомами (рис.4). Большая часть меток была найдена в листьях. Растения на стадии цветения показали аналогичное обогащение 13C в нормальных листьях (260 ‰ + _ 40 ‰) и листьях флага (240 ‰ + _50 ‰, фиг.4B). Это также наблюдалось на ранней стадии заполнения зерна. Однако во время позднего налива зерна флаговый лист был более важным для усвоения 13CO2, что указывалось значительно более высоким обогащением (170 ‰ + _ 10 ‰ в нормальных листьях по сравнению с 270 ‰ + _30 ‰ в листьях флага), что аналогично предыдущим результатам для пшеницы (Triticum aestivum, Rawson and Hofstra, 1969) и в соответствии с ее функцией в качестве основного источника для транспорта углерода в метелку. Стебель не показывал никакого обогащения, в то время как метелка показала низкое накопление 13C во время раннего налива зерна (10 ‰ + _ 5 ‰, фиг.4B).
Количественная оценка транслокации углерода во взрослых растениях риса.
Чтобы оценить транслокацию углерода, растения после периода маркировки продолжительностью 10 мин оставляли в фито-камерах. Образцы, взятые после отчетливых периодов отслеживания, обеспечили временную диаграмму секвестрации 13С. Сразу после инкубации 13CO2 большая часть метки была обнаружена в листьях (фиг.4D). В течение 2 часов дальнейшего роста 13C-обогащение листьев флага и нормальных листьев уменьшилось на 45% и 41% соответственно, в то время как обогащение стебля и метелки увеличилось. Эта тенденция продолжалась до тех пор, пока через 24 часа не было достигнуто максимальное обогащение метелки (100 ‰ + _ 20 ‰) и через 48 часов для стебля (50 ‰ + _ 15 ‰, фиг.4D). Согласно экспериментов на рассаде, данные для взрослых растений показали высокую точность и воспроизводимость."
Продолжение следует.

_________________
С уважением,Владимир.



За это сообщение автора Владимир Александрович поблагодарили: 3 dmitr, Кузьмич В, Пузенко Наталья
Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: Опыт по опровержению теории питания растений
Непрочитанное сообщениеДобавлено: 20 дек 2017, 19:48 
Не в сети
Завсегдатай
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 09 фев 2010, 19:11
Сообщения: 959
Благодарил (а): 1679 раз.
Поблагодарили: 3441 раз.
Город: Волгоград
Подпись: Владимир
skype: ankudinov-vladimir
Сразу скажу,что несколько глав я пропустил,т.к. они интересны узким специалистам (знакомым с аминокислотами).
"ОБСУЖДЕНИЕ.
Количественный анализ путей функционирования и регуляции является ключом к пониманию в инженерии физиологии растений (Maliga and Graham, 2004). Здесь мы разработали рентабельный подход с высокой пропускной способностью для оценки метаболических фенотипов цельного растения in vivo. Как показано, мы проводили исследования воздействия 13CO2 и 15NH4NO3 в точно контролируемых физиологических условиях с ультраточным GC-C-IRMS для параллельного анализа с маркировкой 13C и 15N в различных тканях растений и даже отдельных молекулярных соединений для выяснения признаков метаболизма растений. Различные схемы трубчатого реактора позволили провести изотопные эксперименты 13CO2 с почвенными саженцами и взрослыми растениями на высоте около 1 м (рис.1, А и В), тогда как параллельная маркировка 13CO2 и 15NH4NO3 с культурами гидропонных растений могла быть проведена в конкретных реакторах (фиг.1С). В отличие от предыдущих методов (Tanaka and Osaki, 1983; Nouchi et al., 1995; Römisch-Margl et al., 2007), наша методология минимизирует потенциальные изменения исследуемого растения во время эксперимента из-за атмосферы с естественным уровнем CO2, контролируемой температурой, влажностью и освещенности, а также времени инкубации всего 10 минут. Тщательная экспериментальная компоновка обеспечивала данные с высокой точностью и воспроизводимостью среди реплик, независимо от стадии развития анализируемых растений. Ассимиляция и транслокация углерода в разных тканях (рис. 3 и 4) и даже отдельные молекулы (рис.5) могут быть определены количественно при отклонениях ниже 20% для взрослых растений. Учитывая тот факт, что растения на продвинутых стадиях развития довольно сложны и подвержены определенной биологической вариации, из-за дифференциации на конкретные органы и типы клеток точность и воспроизводимость можно считать превосходными. Для саженцев они были частично еще выше (рис. 6 и 7). Это позволило нам точно различать метаболические свойства, незначительно отличающиеся, что кажется ценной характеристикой нашего подхода.
Оценка важных характеристик углеродного обмена.
Помимо технической точности и тщательности, было также важно проверить степень, в которой метод мог бы оценить основные свойства физиологии растений. Каталог экспериментов рассматривал этот вопрос. Выход урожая, наиболее характерная характеристика сельскохозяйственных культур, сильно зависит от отношения сток-исток между частями растений (Kato et al., 2004), в соответствии с которым режим работы отдельного органа растения, как источник или поглотитель, изменяется во время развития (Meng et al., 2013). Пионерские исследования с рисовыми растениями с использованием радиоактивного 14CO2 при высоких дозах показали транслокацию ассимилированного углерода в метелку во время налива зерна (Cock and Yoshida, 1972). Это было количественно оценено здесь, однако, гораздо более безопасным и легким обращением с использованием стабильного 13CO2. Большая часть ассимилированного углерода была восстановлена внутри рисовой метелки через 24 часа после инкубации (фиг.4D и 5B). В соответствии с этим в течение этого периода охоты (рис. 4D) было обнаружено 90% -ное снижение 13С в ассимиляционной ткани растений со стадии позднего налива зерна (рис. 4D), которая находится в диапазоне значений, сообщаемых для других растений (Leake et al., 2006). Во время развития от цветения до позднего заполнения зерна относительный вклад различных листьев в углеродную ассимиляцию, вероятно, соответствует меняющимся требованиям к метаболизму (Meng et al., 2013). Во время поздней зернистости более низкая активность усвоения углерода в зрелых листьях по сравнению с листом флага указывала на механизмы старения (рис.4). В немолодых листьях содержание Rubisco и, как следствие этого, фотосинтетическая активность быстро уменьшается. Поэтому зрелые листья не могут ассимилировать большее кол-во CO2, чем более молодые листья (Makino et al., 1984). Ночью 13C еще больше терялась при дыхании. Дополнительные потери углерода могут быть вызваны сочетанием транслокации с тканями, которые не были проанализированы (например, корнями растений, выращенных на почве) и разбавлением меток увеличением общей биомассы растений во время периода слежки (Leake et al., 2006)."

_________________
С уважением,Владимир.



За это сообщение автора Владимир Александрович поблагодарили: 4 dmitr, oleg.saratov, Ur-kar, Пузенко Наталья
Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: Опыт по опровержению теории питания растений
Непрочитанное сообщениеДобавлено: 20 дек 2017, 19:53 
В сети
Администратор
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 16 дек 2008, 21:34
Сообщения: 36842
Фотографии: 114
Благодарил (а): 20189 раз.
Поблагодарили: 72754 раз.
Город: Волгоград
Подпись: Наталья Лариасовна
skype: nata_puzenko
Владимир Александрович писал(а):

Сразу скажу,что несколько глав я пропустил,т.к. они интересны узким специалистам (знакомым с аминокислотами).
Володя, пожалуйста покажи их- я знакома с аминокислотами и с удовольствием почитаю. Пожалуйста.

_________________
Каталог 2017-2018


Вернуться к началу
 Профиль Персональный альбом  
 
 Заголовок сообщения: Re: Опыт по опровержению теории питания растений
Непрочитанное сообщениеДобавлено: 21 дек 2017, 17:21 
Не в сети
Завсегдатай
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 09 фев 2010, 19:11
Сообщения: 959
Благодарил (а): 1679 раз.
Поблагодарили: 3441 раз.
Город: Волгоград
Подпись: Владимир
skype: ankudinov-vladimir
Пузенко Наталья писал(а):

Владимир Александрович писал(а):

Сразу скажу,что несколько глав я пропустил,т.к. они интересны узким специалистам (знакомым с аминокислотами).
Володя, пожалуйста покажи их- я знакома с аминокислотами и с удовольствием почитаю. Пожалуйста.

Хорошо.
Количественная оценка обогащения 13C и 15N аминокислот с использованием GC-C-IRMS.
Используя GC-C-IRMS, измерение обогащения метками было расширено до аминокислот. Для каждой аминокислоты, элюирующей из колонки GC, обогащение 13С и 15N давали интенсивностью ионов при отношении массы к потоку (м / з) 45 и 29, что отражало соответственно 13CO2 и 14N15N, образованное сжиганием в приборе. Для 16 аминокислот, обычно удовлетворяющих качеству сигнала, были получены точные оценки их статуса маркировки. Таким образом, аминокислотные пары Glu / Gln и Asp / Asn были количественно определены как сосредоточенные пулы из-за превращения карбоксамидов Asn и Gln в их соответствующие кислоты во время стадии гидролиза белка при обработке образцов (Wittmann, 2007).Четыре аминокислоты (Cys, Met, Trp и Arg) были недоступны, потому что они были деградированы во время этой обработки (Wittmann, 2007). Как правило, 5 мг лиофилизированного материала было достаточным для обеспечения высококачественных данных, независимо от типа обрабатываемой ткани. Условия, связанные с экстракцией, осаждением и дериватизацией белка из лиофилизированного растительного материала, имеют решающее значение в отношении выхода и чистоты полученных аминокислот. В отличие от экстракции в буфере Tris (pH 8,8) экстракция в горячей воде (100 ° C, 15 мин) дает гораздо меньше белка (данные не показаны). Точно так же осаждение экстрагированного белка в ледяной 10% (мас. / Об.) ТСА было менее эффективным, чем осаждение в ледяном ацетоне (данные не показаны). Дополнительные тесты с альтернативными агентами дериватизации показали, что триметилсилильные производные аминокислот (например, полученные с помощью триметилсилилтрифторацетамида) не были полностью разделены. Даже набор изменений в температурном профиле не позволил полностью провести базовое разделение для аминокислот Met / Asp, Ile /Pro и Glu / Phe. Однако необходимо было провести полное разделение базовой линии, поскольку сжигание аналитов в CO2 и N2 до обнаружения не позволяет проводить различия между перекрывающимися пиками аналита. Дериватизация метил-трет-бутилдиметилсилилтрифторацетамидом в трет-бутилдиметилсилильные производные в конечном итоге приводила к полному исходному разделению целевых аналитов. Однако некоторые образцы рассады не дали однозначного сигнала для Tyr, вероятно, из-за наложения матрицы. Из-за того, что интерференция с фоновым шумом или матричными эффектами приводит к ложным результатам в изотопных экспериментах (Wittmann, 2007), эта аминокислота была частично исключена из дальнейшей интерпретации. Также выяснилось, что добавление диметилформамида, обычно используемого для обработки микробных образцов (Wittmann, 2007), несовместимо с используемым прибором GC-C-IRMS, поскольку растворитель в значительной степени переносится в камеру сгорания. Соответственно, дериватизация проводилась без добавления растворителей. Испытания с различными временами инкубации (30, 60, 90 и 120 мин) и температурами (80 ° C, 90 ° C и 100 ° C) показали, что комбинация 60 мин и 80 ° C обеспечивает оптимальный сигнал- шум.
Схемы распределения изотопов.
Динамика включения углерода в белковые аминокислоты.
В настоящее время разработанный протокол используется для количественного определения структур распределения 13C в рисе, связанных с метаболизмом аминокислот (фиг.5). Первое исследование с рассадой показало, что обогащение возрастало со временем, поскольку 13C непрерывно включалось в клеточный белок. Аминокислоты сильно отличались в отношении включения меток, которые, по-видимому, коррелировали с их биосинтетическим происхождением. В частности, Tyr и Phe, происходящие из промежуточных продуктов Embden-Meyerhof-Parnas (EMP) (фосфоенолпируват) и неокислительного пути пентозофосфата (PP) (эритрозо-4-фосфат), обогащались довольно быстро и в большей степени, чем все другие аминокислоты, и способствовали до 9% и 15% от всего (рис. 5А). Сразу после импульса значительная 13C-инкорпорация также наблюдалась для аминокислот, происходящих из пирувата, другого промежуточного соединения пути EMP (то есть Ala, Ser, Gly, Val и Leu). Напротив, маркировка обогащения была отложена для аминокислот, синтезированных из 2-оксоглутарата и оксалоацетата, промежуточных продуктов цикла трикарбоновой кислоты (фиг.5А). Вообще, наибольшие обогащения были обнаружены через 24 часа после импульсов маркировки. Через 48 часов обогащение уменьшилось для большинства аминокислот, вероятно, из-за разведения с помощью 12CO2, введенного во время инкубации после лабиринта. Профили марки 13C Gly и Ser были сходными, что указывает на то, что они происходят из того же метаболического предшественника, 3-фосфоглицерата (Wittmann, 2007). Такая же тенденция была обнаружена и для других семейств аминокислот, как семейство аминокислот Asp, с Thr, Lys, Ile и Asp. По сравнению с саженцами риса общее обогащение аминокислот в среднем было в 8 раз ниже в листьях взрослого растения на поздней стадии заполнения зерна (фиг.5А). Это было интересно, потому что общая ассимиляция углерода обоих типов тканей была в том же диапазоне (фиг.4B, Supplemental Fig.S3) и идеально сочетается с изменением роли листьев от сильного раковины во время развития до основного источника во время размножения, ассимилируя, но не включая углекислый газ (Thrower, 1962; Turgeon, 1989). Низкое обогащение одинаково наблюдалось для нормальных листьев (60 ‰ 6 10 ‰ общее обогащение аминокислот), листьев флага (70 ‰ 6 10 ‰ общего обогащения аминокислоты) и стебля (40 ‰ + _ 25 ‰ общего обогащения аминокислоты) в пределах 1 (фиг.5В). Напротив, метелка взрослых рисовых растений была гораздо более активной в отношении метаболических путей аминокислот (280 ‰ + _ 30 ‰ общее обогащение аминокислот). Здесь наибольшее обогащение было обнаружено для Phe (39 ‰ + _ 3 ‰) и Tyr (30 ‰ + _ 2 ‰), за которым следуют Ala (28 ‰ + _ 4 ‰), Glu (23 ‰ + _ 2 ‰) и Leu ( 22 ‰ + _ 3 ‰), что соответствовало образцу, обнаруженному для саженцев риса. Другие аминокислоты показали более низкое обогащение (фиг.5В).
Объединенная 13C и 15N Регистрация в белковых аминокислотах.
Аминокислоты побега анализировали на их обогащение 13C и 15N из комбинированных экспериментов по маркировке 13CO2 и 15NH4NO3 с выращиваемыми на гидропонике саженцами риса (рис.6). Для шести выбранных аминокислот (например, Ala, Gly, Pro, Ser, Asp и Glu) могут быть получены данные на основе корней с удовлетворительным качеством, что позволило провести исследование ткани, по крайней мере для этих молекул (фиг.6) , Сразу же после маркировки было обнаружено сильное 15N-обогащение для Ser, Asp и Glu корневого белка. В то же время Ala, Gly и Ser, экстрагированные из белка побега, показали значительное обогащение 13C (фиг.6). В течение 2 часов меченые соединения распределялись внутри растения, что приводило к объединению 13C- и 15N-обогащенных аминокислот в побегах и корнях. Хотя все аминокислоты проявляли существенно различное обогащение 13C и 15N, наиболее сильные различия были обнаружены для аминокислот побега. Ala и Ser демонстрировали более высокое обогащение 13C, тогда как Pro, Asp и Glu сильно обогащались 15N. Через четыре часа после импульсов маркировки аналогичные образцы обогащения аминокислот стебля и корня указывали на уравновешивание метки между этими органами (фиг.6). Модели обогащения аминокислот были сходны для почвообразованных и выращенных на гидропонике саженцев риса (дополнительный рисунок S4), что указывает на то, что гидропонное культивирование не оказало существенного влияния, по крайней мере, на эту часть метаболизма."

_________________
С уважением,Владимир.



За это сообщение автора Владимир Александрович поблагодарил: Пузенко Наталья
Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: Опыт по опровержению теории питания растений
Непрочитанное сообщениеДобавлено: 24 дек 2017, 10:26 
Не в сети
Завсегдатай
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 09 фев 2010, 19:11
Сообщения: 959
Благодарил (а): 1679 раз.
Поблагодарили: 3441 раз.
Город: Волгоград
Подпись: Владимир
skype: ankudinov-vladimir
Наконец, завершающие главы из статьи.
"Комплексный анализ углеродного и азотного метаболизма. Кроме того, установка позволила провести комбинированные исследования по маркировке 13CO2 и 15NH4NO3, которые интересны из-за тесной связи метаболизма углерода и азота в растениях, но были проведены только редко (Cliquet et al., 1990; Dyckmans et al., 2000). В исследованиях было показано быстрое межорганизационное распределение углерода и азота в проростках в течение 2 часов после усвоения (рис.2), в результате чего побег работал как основной приемник и проявлял в 10 и 6 раз более высокий спрос на соединения углерода и азота, соответственно, в сравнении с корнем (рис.3А), который отражает достаточный запас воды и питательных веществ, особенно азота (Wilson, 1988; Peuke et al., 1994). Очевидно, что исследованные саженцы получили все существенные макроэлементы и микроэлементы и были подвержены оптимальным условиям размножения, касающимся света, температуры и влажности, так что углерод и азот использовались главным образом для роста и развития побегов. Относительные графики потоков для углерода и азота, дающие относительное распределение между различными тканями на основе данных изотопного обогащения, обеспечивает простой снимок метаболизма растений (рис.3). Учитывая имеющиеся инструменты, такое понимание может быть легко предоставлено в течение 1 дня после изотопного эксперимента и, таким образом, позволяет провести быструю оценку (например, для изучения экологических стрессов, как показано для риса с солью, рис. 2 и 3В). В свете размножения стрессоустойчивых растительных линий важной областью применения является метаболическое фенотипирование с целью выявления защитных механизмов (Cramer et al., 2011) и изменения отношений с истоком-источником (Roitsch, 1999; Albacete et al., 2014). ). Наши данные отражают эти особенности для растений, подверженным воздействию соли, основным абиотическим фактором, особенно влияющим на рост и продуктивность солесодержащих культур (Roy et al., 2014). Соленый стресс приводил к сильному уменьшению поглощения азота корнем и переносу в побег, тогда как ассимиляция и транслокация углерода не ощутили существенного влияния. Подверженные стрессу растения содержали относительно больше азота в корне по сравнению с нестерилизованными растениями (фиг.3), вероятно, для поддержки снабжения азотсодержащими совместимыми растворами (Wang et al., 2012). Кроме того, усиленное удержание соединений азота в корне может быть связано с адаптивными механизмами для обеспечения достаточного сбора воды и питательных веществ из ризосферы (Sharp et al., 2004).
Динамика меченых аминокислот обеспечивает качественное понимание метаболических путей.
Сочетание C-IRMS с разделением на ГС, а также разработка подходящих протоколов для отбора проб и обработки образцов обеспечили сведения,точно привязанные по времени, по обогащению белков аминокислотами в разных тканях риса. Аминокислоты являются аналитами выбора для анализа микробиологических путей, поскольку они намного более многочисленны в клеточных экстрактах и белках, чем их предшественники, и предоставляют обширную информацию при использовании маркировки (Wittmann, 2007). На основе лежащей в основе биосинтетической аминокислотной реакции предшественника легко вывести образцы мечения метаболитов предшественников из образцов маркировки соответствующих аминокислот.
13C-маркировка аминокислот из того же семейства биосинтеза была сходной и, очевидно, отражала обогащение их общего предшественника (фиг.5A). В рассаде аминокислоты, происходящие от предшественников пути ЭМП и неокислительного пути РР, демонстрируют быстрое и сильное обогащение 13С (рис.5А, верхняя часть), примерами являются Phe, Tyr, Ser, Gly и His. Напротив, Glu, Pro, Asp и Thr, происходящие из предшественников на основе трикарбоновых кислот, были помечены намного медленнее и слабее. Хотя это напрямую не обеспечивает количественные скорости потока, данные обогащения 13C показывают быстрый и сильный приток 13C в путь EMP и неокислительный путь PP, что указывает на высокую активность этих маршрутов. Очень низкое обогащение аминокислот, связанных с циклом трикарбоновых кислот, наиболее вероятно, отражает понижающую регуляцию цикла в свете (Tcherkez et al., 2005). Кроме того, медленная динамика может быть признаком того, что Glu, Asp и аминокислоты, полученные из них, не образуются в побеге, а скорее синтезируются в корне, а затем транспортируются в побег. Это действительно имеет место, что обсуждается ниже на основе интегрированных данных маркировки 13C и 15N (рис.6). Обогащение 13C в побеге рассады было примерно в 8-10 раз выше, чем в листьях взрослого рисового растения (рис. 5А, внизу). Взрослые листья усваивали предоставленный 13CO2 в высокой степени (фиг.4), но лишь незначительно включали его в белок. Это соответствует изменению роли листьев от сток до истока во время размножения, ассимиляции, но не включения углекислого газа (Thrower, 1962; Turgeon, 1989).
Динамика маркированных аминокислот характеризуется специфическим метаболизмом тканей.
13C-маркировка аминокислот существенно различалась между отдельными тканями. Для риса при позднем наливании зерна лист, флаговый лист и стебель включали лишь немного углерода в белок (фиг.5В). Метелка показала самое высокое обогащение 13C среди всех тканей. Поэтому наиболее усваиваемый углерод был перемещен в метелку, где она была включена в протеиногенные аминокислоты. Метелка проявила активный биосинтез белка de novo, отражающий, что заполнение зерен приводит к сильному спросу на прекурсоры белка (Cock and Yoshida, 1972). Смешанно-ориентированный взгляд, основанный на статистической значимости меток маркировки, группирует аминокислоты в цветные эллипсы в соответствии с их сходством с маркировкой (фиг.5С). Это сразу подчеркивает специфические метаболические отпечатки пальцев для всех тканей риса. Лист и флаговый лист отличались только несколькими аминокислотами, тогда как стебель и метелка выявили радикально измененные закономерности и доказательства тканеспецифического метаболизма углерода. Этот вид визуализации еще больше выявил сильные различия между усвоением углерода взрослым листом и молодым побегом.
Динамика маркирования обеспечивает пространственное разрешение метаболизма аминокислот.
Комбинированная маркировка 13C и 15N гидропонных рисовых саженцев показала немедленное появление в корне 15N меченых Glu / Gln и Asp / Asn, тогда как 13C-меченые формы появились намного позже (фиг.6C). Очевидно, что эти аминокислоты были образованы из предшественников углерода в корне через ассимиляцию 15NH4 и трансаминацию (Lam et al., 1995), что объясняет исключительное обогащение 15N (фиг.6, A и C). Впоследствии они транспортировались в побег (Funayama et al., 2013), чтобы служить в качестве доноров аминогрупп для биосинтеза других аминокислот (Kiyomiya et al., 2001). Glu с его довольно высоким содержанием 15N и низким содержанием 13C, синтезированным в корне и переносимым на побег (фиг.6B, 2-часовая точка), является предшественником синтеза de novo Pro, имеющего аналогичную схему маркировки. Непосредственное обогащение 13C (фиг.6B, 0-h time point) указывает на быстрый биосинтез Ala, Gly и Ser в побеге. Для Gly и Ser это может быть связано с фотодыханием, что обычно приводит к высоким коэффициентам текучести для этих аминокислот (Gauthier et al., 2010). В целом, это обеспечивает пространственно разрешенную картину метаболизма аминокислот (рис.6), что объясняет разную динамику обогащения 13С и 15N. Из аналогичных эффектов после одновременной маркировки растений из рапса (Brassica napus) с 13C и 15N было высказано предположение, что включение ассимилированных 13C в аминокислоты не тесно связано с ассимиляцией азота (Gauthier et al., 2010). Это, по-видимому, также верно для риса.
ВЫВОД.
В совокупности разработанный подход подходит для проведения стабильных экспериментов по измерению изотопов для анализа метаболизма in vivo в целом. Высокое качество технических данных, достижимое в физиологически значимых условиях, представляется особенно перспективным для применения: (1) исследований стрессового ответа, (2) фенотипического скрининга линий растений, (3)в исследованиях методы- действие и (4) комплексного анализа метаболизма углерода и азота, среди прочих. Основные исследования трассировщика требуют мало времени и малых усилий по сравнению с подходами на основе моделей и являются мощными инструментами для скрининга (Schwender, 2008). Очевидно, что этот тип анализа сам по себе не обеспечивает количественные внутриклеточные потоки через отдельные реакции и пути, но он может указывать на метаболические активности (например, профили перераспределения или метаболические отпечатки пальцев). В этом отношении наш подход обеспечивает полезное дополнение к более требовательным подходам изотопически нестационарного анализа метаболического потока (Szecowka et al., 2013; Ma et al., 2014). Последнее предлагает наибольший потенциал для количественного разрешения метаболических потоков в автотрофных растениях, но требует экстремальных экспериментальных и вычислительных усилий, высокой стоимости и низкой пропускной способности для получения информации о потоках. В этом отношении будущие комбинации обеих технологий для двухуровневого дополнительного анализа могли бы предоставить физиологам растений сложный инструментарий для первоначального скрининга нескольких различных фенотипов, тем самым выявив наиболее перспективные для более полного анализа. Высококачественный анализ GC-C-IRMS, продемонстрированный здесь для аминокислот, может быть легко расширен до жирных кислот (Meier-Augenstein, 2002; Richter et al., 2010;Panetta and Jahren, 2011), стеролов (Jones et al., 1991), моносахаридов (Docherty et al., 2001; Derrien et al., 2003) и лигнина (Goñi and Eglinton, 1996), которые доступны через такие инструментарии. Это обещает расширить подход к другим путям первичного метаболизма (например, биосинтеза липидов, сахара и клеточной стенки), а также к путям вторичного метаболизма (например, с участием фенола, изопреноида и биосинтеза алкалоидов)".

_________________
С уважением,Владимир.



За это сообщение автора Владимир Александрович поблагодарили: 4 biocenosis, dmitr, Кузьмич В, Пузенко Наталья
Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: Опыт по опровержению теории питания растений
Непрочитанное сообщениеДобавлено: 25 дек 2017, 10:26 
Не в сети
Завсегдатай
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 01 окт 2012, 12:19
Сообщения: 2817
Благодарил (а): 5617 раз.
Поблагодарили: 6758 раз.
Город: Ижевск, дача широта 55.89, долгота 53.082
Подпись: Дмитрий
У меня Владимир возникло несколько вопросов , хоть на предыдущий ты так и не ответил, углубившись в переводы англоязычных статей.
Во-первых, ты пишешь

Владимир Александрович писал(а):

Обращаю внимание на две вещи:первое-время инкубации в опытах всего 10 минут,а далее измерение усвоения и транслокации.


Далее ты со ссылкой на скорость диффузии делаешь вывод о невозможности перемещения СО2 через корни за данный период.
Однако вот твои же ссылки. К примеру

Владимир Александрович писал(а):

Чтобы оценить транслокацию углерода, растения после периода маркировки продолжительностью 10 мин оставляли в фито-камерах.

или вот

Владимир Александрович писал(а):

Сравнивались модели ассимиляции растений на разных стадиях развития, отобранные сразу после 10-минутного облучения мечеными атомами (рис.4)


Похоже ты немного напутал. 10 минут в тексте относиться к периоду облучения (маркировки) . То есть говоря проще после некоего периода проведения опыта , растения 10 минут облучают , а затем считают количество , так сказать засвеченного углерода. То есть 10 минут это время для снятия инфо .
Понимаешь о чём идёт речь? Ты же пишешь совсем о другом. Похоже ты немного запутался в неадаптированном переводе.

И второй вопрос , а что собственно говоря хотели авторы опыта доказать или опровергнуть. Из неодаптированного перевода я так и не понял.

Добавлено спустя 15 минут 12 секунд:
Владимир Александрович писал(а):

И второе-слова Дмитрия,что диффузия эффективна на малых расстояниях. Тут я с ним никогда не спорил.


Спорил , спорил ! :yes: Ещё как . Дискуссия была на несколько страниц. :D

_________________
С уважением Дмитрий Артемьев



За это сообщение автора dmitr поблагодарил: biocenosis
Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: Опыт по опровержению теории питания растений
Непрочитанное сообщениеДобавлено: 25 дек 2017, 11:25 
В сети
Завсегдатай
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 30 авг 2015, 17:11
Сообщения: 1089
Благодарил (а): 2685 раз.
Поблагодарили: 2557 раз.
Город: Саратов
Подпись: Владимир
dmitr писал(а):

10 минут в тексте относиться к периоду облучения (маркировки) . То есть говоря проще после некоего периода проведения опыта , растения 10 минут облучают , а затем считают количество , так сказать засвеченного углерода

Небольшое уточнение:
Изотопы углерода С13 и азота N15, которые использовались в опытах, не являются радиоактивными, т.е. они стабильные, поэтому ничего не излучают, как и обычные атомы С12 и N14.



За это сообщение автора biocenosis поблагодарили: 2 dmitr, Пузенко Наталья
Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: Опыт по опровержению теории питания растений
Непрочитанное сообщениеДобавлено: 25 дек 2017, 12:57 
Не в сети
Завсегдатай
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 01 окт 2012, 12:19
Сообщения: 2817
Благодарил (а): 5617 раз.
Поблагодарили: 6758 раз.
Город: Ижевск, дача широта 55.89, долгота 53.082
Подпись: Дмитрий
biocenosis писал(а):

Небольшое уточнение:
Изотопы углерода С13 и азота N15, которые использовались в опытах, не являются радиоактивными, т.е. они стабильные, поэтому ничего не излучают, как и обычные атомы С12 и N14.


Это я то же в статье прочитал . Однако по тексту идёт (повторюсь)

Владимир Александрович писал(а):

Сравнивались модели ассимиляции растений на разных стадиях развития, отобранные сразу после 10-минутного облучения мечеными атомами (рис.4)


То есть именно теми самыми меченными атомами облучают судя по переводу. Перевод статьи явно не внушает доверия.

_________________
С уважением Дмитрий Артемьев



За это сообщение автора dmitr поблагодарил: biocenosis
Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: Опыт по опровержению теории питания растений
Непрочитанное сообщениеДобавлено: 25 дек 2017, 13:50 
В сети
Завсегдатай
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 30 авг 2015, 17:11
Сообщения: 1089
Благодарил (а): 2685 раз.
Поблагодарили: 2557 раз.
Город: Саратов
Подпись: Владимир
dmitr писал(а):

То есть именно теми самыми меченными атомами облучают судя по переводу. Перевод статьи явно не внушает доверия.

Проблемы с переводом никакой нет, когда есть оригинал текста статьи :)
Смысл сказанного простой:
10 минут растения риса выдерживались в атмосфере с углекислым газом С13О2.
После этого растения помещали в обычную атмосферу и смотрели, в какие части растения попадал углерод С13 и в какие вещества включался. То же самое делали после замены раствора обычной аммиачной селитры на селитру, содержащую N15, которую давали через корни.
10 минутную инкубацию с изотопированными веществами (углекислым газом и селитрой) авторы называют импульсным мечением. Потому что наблюдают они потом за миграцией и превращением меченых веществ в тканях растения в течение большого времени (на графике 48 часов).



За это сообщение автора biocenosis поблагодарили: 3 dmitr, Miсhailа, Пузенко Наталья
Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: Опыт по опровержению теории питания растений
Непрочитанное сообщениеДобавлено: 26 дек 2017, 07:58 
Не в сети
Завсегдатай
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 01 окт 2012, 12:19
Сообщения: 2817
Благодарил (а): 5617 раз.
Поблагодарили: 6758 раз.
Город: Ижевск, дача широта 55.89, долгота 53.082
Подпись: Дмитрий
biocenosis писал(а):

Проблемы с переводом никакой нет, когда есть оригинал текста статьи :)
Смысл сказанного простой:
10 минут растения риса выдерживались в атмосфере с углекислым газом С13О2.
После этого растения помещали в обычную атмосферу и смотрели, в какие части растения попадал углерод С13 и в какие вещества включался. То же самое делали после замены раствора обычной аммиачной селитры на селитру, содержащую N15, которую давали через корни.
10 минутную инкубацию с изотопированными веществами (углекислым газом и селитрой) авторы называют импульсным мечением. Потому что наблюдают они потом за миграцией и превращением меченых веществ в тканях растения в течение большого времени (на графике 48 часов).


А о каком облучении меченными атомами тогда речь идёт в приведенном мною отрывке?

_________________
С уважением Дмитрий Артемьев



За это сообщение автора dmitr поблагодарил: biocenosis
Вернуться к началу
 Профиль  
 
Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 2821 ]  На страницу Пред.  1 ... 279, 280, 281, 282, 283  След.

Часовой пояс: UTC + 3 часа


Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: СергейАК и гости: 7


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Перейти:  



Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group
Русская поддержка phpBB

Рейтинг@Mail.ru